清理苹果手机Safari浏览器历史痕迹的方法如下：
1. 打开Safari浏览器，点击左上角的“Safari”图标。
2. 在菜单栏中，点击“设置”。
3. 在设置页面中，找到“隐私与安全”选项，点击进入。
4. 在隐私与安全页面中，找到“网站数据”选项，点击进入。
5. 在网站数据页面中，找到你想要清理历史痕迹的网站，点击进入。
6. 在网站数据页面中，找到“清除浏览数据”按钮，点击进入。
7. 在清除浏览数据页面中，选择你想要清理的数据类型，如Cookies、历史记录、缓存等，然后点击“清除”按钮。
8. 等待清除完成后，返回到Safari浏览器首页，刷新一次，即可看到历史痕迹已被清除。